RNA codificante o mensajero

El RNA codificante, también llamado RNA mensajero (RNAm), constituye sólo 4% del RNA total de una célula. El DNA que determina la síntesis de este ácido nucleico se denomina DNA codificante y sus productos se conocen como transcritos o preRNAm. La mezcla de preRNAm + RNAm se conoce como RNA heterogéneo nuclear (hnRNA) y al unirse con determinadas proteínas forma las hnRNPs. Algunas de esas proteínas se quedan en el núcleo y otras acompañan al complejo RNAm + proteínas (RNPm), cuando es exportado al citoplasma.

 La secuencia del RNAm es equivalente a la de la cadena del DNA “con sentido” del gen en cuestión y las diferencias son que en lugar de tener timinas tiene uracilos, y la presencia de ribosa en lugar de desoxirribosa en el esqueleto azúcar-fosfato. Por lo tanto es producto de la síntesis complementaria que toma como molde a la cadena “sin sentido” del DNA Imagen. 

La vida media del RNAm es muy corta, en procariontes es degradado minutos después de su síntesis, mientras que en eucariontes sucede esto pocas horas después de la transcripción. Sin embargo, se ha demostrado en ovocitos de Xenopus que puede ser almacenado como complejo RNAm-proteínas (mRNPs), lo que determina la modulación de su  traducción.

Los genes codificantes de las células eucariontes están constituidos por exones e intrones. El cuerpo central del gen está integrado por el sitio de inicio (+1), la caja TATA y el promotor proximal. Los intensificadores o las secuencias silenciadoras pueden situarse a miles de pb del gen, curso arriba o curso abajo de (+1) Imagen.

La transcripción involucra a los promotores que inducen el inicio de la transcripción del RNAm en procariontes y del preRNAm en eucariontes. En eucariontes, la síntesis del preRNAm también se lleva a cabo por la acción de la RNA polimerasa II (RNApol-II), con la cooperación de los factores de transcripción generales o basales (TFs), los activadores y los mediadores.

La RNApol-II se caracteriza por tener un dominio COOH terminal (CTD) que coordina la síntesis, al ser el sitio donde se unen los complejos enzimáticos del proceso. El promotor tiene un cuerpo central que incluye a la caja TATA en el sitio –25 y en la región de inicio hay una adenina (A) flanqueada en ambos lados por pirimidinas. La activación de este promotor produce una síntesis baja del preRNAm correspondiente.